L'album est divisé en trois parties, appelées des « cycles » (bien que tous sur un CD)
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Les symboles
Comme c'est le cas avec la plupart des albums de Manson, Antichrist Superstar comporte de nombreux symboles et de messages cachés, tout en décrivant comment le ver (l'ignorant) naît puis devient un homme et enfin un surhomme (comme celui décrit par Nietzsche), incarné par la figure biblique de l'antéchrist, qui ayant atteint la divinité doit mourir et renaître
Cycle I - The Heirophant
Le Heirophant est la 5e carte du jeu de Tarot et symbolise à la fois la prédiction de l'avenir, l'interprète et l'avocat. Manson annonce l'arrivée de l'antéchrist, tout en étant son propre avocat.
Irresponsible Hate Anthem
Bien que l'album soit sorti en 1996, le livret indique que ce titre est un live joué le 14 Février 1997 (la St Valentin, donc). Toutes les paroles ne sont pas écrites dans le livret, notamment le "When you are suffering, know that I have betrayed you" (Quand tu souffres, sache que je t'ai trahi) au début de la chanson, "America cannot see anything (3 fois)... History was written by the winners" (L'Amérique ne peut rien voir... L'histoire a été écrite par les vainqueurs) vers la fin et May all the children sing : we hate love, we love hate. Manson annonce l'arrivée de l'antéchrist.
The Beautiful People
Brian Warner est né, il observe le monde. Il observe la domination des forts sur les faibles, comment la vision de la beauté est contrôlée par les plus forts (médias...). En gros, ce qui est fort est beau, ce qui est faible est laid.
Dried Up, Tied And Dead To The World
All dried up and tied up forever... Manson se compare en quelque sorte ici avec Jésus-Christ et affirme être un martyr. Les chrétiens sont en train de recommencer la même erreur avec lui. Cette chanson est aussi en quelque sorte l'allégorie de sa mère, avec un caractère très autobiographique.
Tourniquet
Au début de la chanson, Manson murmure quelque chose. D'après son autobiographie, il murmure à l'envers This is my most vulnerable moment. Manson est ici vulnérable, il parle d'amour et essaye de créer une créature innocente pour pouvoir l'aimer.
Cycle II - Inauguration of the Worm
Le passage fait référence au ver et au surhomme de Nietzsche. Brian est devenu Marilyn Manson. Ce cycle raconte le passage du ver à l'homme, pour ensuite devenir un surhomme.
Little Horn
Le temps est venu pour le ver de devenir un véritable homme.
Cryptorchild
I wish I had balls, Brian est maintenant adulte. Le ver obtient ses ailes. Il est maintenant puissant (d'où la mention du chiffre 7 qui est le chiffre de la puissance) et peut prendre des décisions tout seul, sans être une victime de l'autorité parentale et sociale.
Deformography
Manson est devenu une star et parle ici aux fans. Il affirme que devenir star est dur, mais possible, mais qu'il est inutile d'essayer de le copier étant donné qu'il est unique.
Wormboy
Le chanteur n'a plus peur des péchés car il sait que Dieu n'existe pas. Il pousse ses fans à faire de même. Il faut profiter de l'instant présent sans se soucier de ce qui va se passer après la vie.
Mister Superstar
Un passage entier n'est pas mentionné dans le livret : I wish I was dead, I wish I was dead - Kill yourself on TV, I wish you'd kill yourself on TV, Will you kill yourself on TV - We'd like to see you dead, We'd like to see you dead (Je voudrais être mort, je voudrais être mort - Tue toi à la télé, j'espère que tu te tueras à la télé, te tueras tu à la télé - Nous voulons te voir mort, nous voulons te voir mort). Le passage Hey, Mr Superstar, I'll kill myself for you. Hey, Mr Superstar, I'll kill you if I can't have you (Hey, Mr Superstar, je me tuerais pour toi. Hey, Mr Superstar, je te tuerais si je ne peut pas t'avoir) a été rajouté suite a une lettre de fan. Manson est maintenant mondialement connu (d'où l'image de la télé), mais plonge dans une profonde déception. Les fans n'aiment pas sa personnalité mais sa propre image. Manson est devenu prisonnier de son image. Il est désespéré.
Angel With The Scabbed Wings
L'ange mentionné n'est rien d'autre que Manson, l'ange déchu (possible allusion avec Samaël). Il a été corrompu par la société et affirme qu'il peut choquer les autres (en l'occurance les fans).
Kinderfeld
Le titre de la chanson signifie en allemand le champ de batailles des enfants. La chanson devient plus calme et plus morbide, c'est en quelque sorte une pause dans l'album. L'ange profite de revenir à son enfance. 3 personnages sont ici présents, le ver (Brian), le destructeur (Manson) et son grand père, Jack Warner. Manson montre la personnalité étrange de son grand père et la relation abusive qu'il a entretenu avec lui.
Cycle III - Disintegrator Rising
Le désintégrateur... L'ange détruit tout sur son passage
Antichrist Superstar
L'étape finale de la transformation, Manson est devenu l'antéchrist superstar. C'est l'image du surhomme : Nietzsche l'a prédit, l'Amérique l'a créé, Marilyn Manson l'est devenu. Il y a encore des paroles caché dans cette chanson, les mêmes que dans Irresponsable-Hate Anthem (When you are suffering, know that I have betrayed you)
1996
L'antéchrist explose sa haine envers la société. Il devient l'anti-tout comme le montrent les paroles de la chanson. Il nous déteste pour l'avoir transformé en ce qu'il a horreur. La haine de l'antéchrist est tellement grande qu'il se contredit lui-même (Anti-song and Anti-me). Il est tout simplement agacé par son existence (I don't deserve a chance to be).
The Minute of Decay
L'ange craque. Parfaitement seul, il pense que son combat est inutile. C'est la chanson la plus dépressive de l'album. The minute that it's born, it begins to die, finalement l'ange se rend compte qu'il est voué à la mort. Lors du premier enregistrement Manson avait versé toutes les larmes de son corps un peu comme vers la fin de la chanson quand il dit : "I'd love to live this lie", et le producteur (Trent Reznor) lui a dit "T'en fait trop là !" Manson s'est vexé, l'a insulté et a recommencé sa prise...
The Reflecting God
You'll understand when I'm dead (référence à Nietzsche), l'ange est incompris. Manson fait ici allusion à la doctrine "soit ton propre dieu, n'ai confiance qu'en toi" (I went to God just to see, and I was looking at me) de Anton Szandor LaVey, rencontré plus tot en 1994.
Man That You Fear
C'est la mort de l'antéchrist superstar. Manson condamne l'Église chrétienne pour l'avoir créé. Il se compare à un prophète trahi par les siens, qui doit mourir pour accomplir sa mission. En effet, dans le clip de la chanson, Manson se fera lapider par sa famille et ses amis. Il y a encore une fois des paroles cachées, When all of your wishes are granted, many of your dreams will be destroyed (Lorsque tous tes voeux sont accordés, la plupart de tes rêves seront détruits) qu'on entend plusieurs fois à la fin de la chanson.
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Piste 17 à 98
Profond silence. Peut-être quelques minutes de silence pour la mort de l'antéchrist.
Piste 99
A la fin de la chanson, on retrouve le "When you are suffering, know that I have betrayed you" du début de l'album. À la manière de l'ouroboros, le cd est sans fin car le début de la piste 1 est la fin de la piste 99. Cela annonce le retour de l'antéchrist. Dans ce morceau, une voix est pleine d'interferences et l'autre est très claire et ressemble a celle de Manson, c'est donc l'antéchrist qui parle avec quelqu'un...
